Struktūriniai padaliniai

Muitinės informacinių sistemų centro struktūrinių padalinių uždaviniai ir funkcijos

Kompiuterių įrangos skyrius

Informacinių technologijų paslaugų skyrius

Informacinių ir ryšių technologijų skyrius

Programų skyrius

Projektų skyrius

Muitinės informacinių sistemų priežiūros skyrius